CentOSでホストしているwebサーバーにwordpressで新しいwebサイトをインストールしようとしたところ、 wp-admin/install.php の時点で真っ白に。 別のディレクトリでは動いているのでphpなどの問題ではない エラーを見たところ500が出ている。 パーミッショ…
Mac OS X Sierraで、ターミナルアプリでSSHを使ってリモートのマシンにアクセスしているとき、 UTFの記号の表示がおかしい、日本語が入力できない（zshのプロンプトやshの上のemacsに 日本語を入力すると、変換を確定したときに文字が消える）などの症状がht…
logicoolから発売されたプレゼンテーションマウス「Spotlight」、ソフトウェア的にポインタを スライド上に表示するのでレーザーポインタよりも使いやすいのだが、Sierraにアップグレードしたら bluetoothでペアリングができなくなってしまった。で、下記の…
emacsでcshのシェルスクリプトを編集しようとしたところ、改行のたびに余計なインデントが追加されてしまう現象が発生。 どうもemacs 24でsh-modeの仕様が変わったこと、csh-modeがちゃんと整備されていないことの二点が原因の模様。まず https://github.com…
Yosemiteにjava ver. 8 (1.8.0_45)を入れて使っていたのだが、illustrator CS6を起動しようとしたら「旧バージョンのjavaが必要だ」とのたまうダイアログが出て起動できなくなっていた。ググって見つかる対処法は、Yosemiteにまだjavaを入れていない場合の話…
Mac OS XのTerminal.app上でemacsを使っていると、いわゆる全角の記号などが表示された後ろで カーソルの位置や文字の表示がずれる。Control+lで再表示すると一旦直るが、カーソルが移動するとまたおかしくなる。 全角を使うつもりが無くても、文書内のシン…
bowtie2 + cufflinksで発現解析をする際、 参照配列の配列定義文字列内に:が含まれているとError: sort order of reads in BAMs must be the sameなるエラーで落ちる。
Mac OS X Lion 10.7.4での現象ですが、 ネットワークブートで使っている場合、ログイン直後にX11を起動すると、 非常に高い確率で ＊＊＊カーネルパニックになります＊＊＊ OSごとクラッシュです。再起動するしかありません。 ネットワークがからんでいるの…
Mac OS X のLionは、終了したアプリのウィンドウなどを次の起動時に再現しようとする。 便利と思う人もいるのかもしれないが、Safariで大量のタブを開いていたものをまた 読みにいこうとするなど、うっとおしいことのほうが多い。 一般的には 「環境設定」＞…
Windows 上のputty sshを使ってMac OS X サーバー上のネットワークアカウントにログインする際、 ログインしようとするユーザーが directaccess グループに入っていないと認証を拒否される、っぽい。
Time Machineは便利なんで愛用しているのですが時々 バックアップイメージがおかしくなるという問題が。一旦イメージが壊れると、新しいバックアップができなくなり 「Time Machine でのバックアップの検証が完了しました。 信頼性を向上させるには、Time Ma…
slam_0.1-23.tar.gz をソースからインストールしようとするとld: library not found for -lgfortran collect2: ld returned 1 exit statusとのエラーでインストールができない。どこでこんなオプションが追加されるのか、と探すと、 /Library/Frameworks/R.f…
出先でのMacBookの接続用にUQ WiMAXのUSB端末（WM3200U）を使っていたのだが、 先日MacOSX Lionにアップグレードしたら認識しなくなった。あれこれ調べてみた所、ドライバが32bit版のkernelにしか対応していないとのこと。 Lion から64bit版カーネルが通常起…
ネットワークの構成を変えて、サーバーにルーター越しに接続するようにしたところ、 10分ほど離席するとsshのコネクションが切断される症状が。パケットが一定時間流れないとルーターのNATテーブルが廃棄されてしまうため、 timeoutの設定を変えるか、定期的…
Windows7 でキーボードの配列を英語配列／日本語配列に変える方法 [スタート]−[ファイル名を指定して実行] から regedit.exe を起動します。 HKEY_LOCAL_MACHINE/SYSTEM/CurrentControlSet/Services/i8042prt/Parameters を開きます。 LayerDriver JPN のデ…
eclipseでRのソースを開発／実行するための便利なプラグインStatETを使うeclipseをダウンロードし、インストール（解凍としたフォルダをApplicationフォルダにコピー）eclipseを起動 help > Install New Software... を選択 Work with: の入力フォームにStat…
Windowsマシンがお亡くなりになったのだがHDからThunderbirdのメールデータをサルベージするのが意外と面倒だった。データ自体がまず隠しフォルダに入っているので、コントロールパネルのデスクトップの設定から、表示オプションのなかの「隠しファイル／フ…
BioconductorのEBImageパッケージをWindows上のRにインストールする。基本的にvignettesの指示の通りにしないとだめ。まずR本体を R-2.10.0-win32 にアップグレードgtk+-2.10.13-setup をダウンロード、インストール。 環境変数でpathを通す必要があるがたぶ…
Mac OS Xでは/etc/hostsは存在するが、実際には使われていない。 （起動時だけ意味を持つ、らしい） そのため、他のUnix系のように、/etc/hostsを編集しても DNSで引けないIPアドレスにホスト名やエイリアスを対応させることができない。Leopard以前では「Ne…
Mac OS X LeopardではOpen Directoryサーバへの接続と NFS等でオートマウントするディレクトリの設定を 「ユーティリティ」フォルダにあった「ディレクトリユーティリティ」で行っていたが、 Snow Leopardではこれが無くなっている。Open Directoryへの接続…
Mac OS X Leopardで、Finderの「画面を共有...」から他のマシンを操作している際、 ログインせずにユーザーの切り替えを行った場合などに、 「画面共有」のウィンドウが消えてしまい、 再度接続しようとしてもウィンドウが表示されない、といった現象が起こ…
macosx leopardのマシンをファイルサーバにして、 sambaでアクセスしているのだが、 leopardをアップデートした際に、 windowsマシンからアクセスができなくなったり、 自分のフォルダが見えなくなったりするトラブルが起きた。どうやら原因は /etc/smb.conf…
LaTeXiTを使おうとしたらコンパイルした数式に pxpxpxなるゴミが残るようになってしまっていて困っていた。geometry.styが古いとpxを単位としたレイアウト指定に対応していないのが 原因なのまではつきとめたが、うまくデバッグができず。結局 http://d.hate…
windowsで、Rcmd上での作業でRMySQLが必要になる。Windows版MySQLのインストール http://dev.mysql.com/downloads/mysql からwin32版をダウンロード、 Complete installを選択RMySQLのインストール MySQL直下のフォルダーからlibmysql,をコピー Rの直下のフ…
cvsにもsubversionにも挫折したのだが性懲りもなくbazaarの導入を試みる bzr branch sftp://myserver.mynetwork/workingDirectoryとすると親ディレクトリからのコピーがローカルに作られる bzr update [file or directory]でローカルコピー[の一部]を更新 bz…
Leopard でもNFSのexportは /etc/exportで管理している、模様。 exportの書式は通常と変わらず。 /Users -alldirs -maproot=nobody とか書いておけばいい。exportを書き換えたらnfsdを再起動させる、hungupシグナルを送る、updateオプションつきで起動する、…
GNU screen上でemacs上でESSモードを使っている時という非常に限定された環境での話。ESSモードでRを起動していろいろ作業していると、カーソルの挙動がおかしくなることがある。 画面上のカーソルの位置と、実際のカーソルの位置が合わず、文字が変なところ…
sudo installer -pkg package.pkg -target /
hdiutil mount diskimage.dmg
コマンドラインの小ネタ二本。
